Sant Joan de Binissaida cuenta actualmente con 12 habitaciones, diseñadas respetando el más puro estilo menorquín. Todas ellas gozan de vistas y de gran belleza sobre el campo o sobre la cala de Sant Esteve y la entrada del Puerto de Mahón, y están equipadas con todos los servicios indispensables para su comodidad (TV de plasma, equipo de música, teléfono, conexión a Internet, canal Satélite, caja fuerte, secador, calefacción, etc.). Las camas disponen de colchones y sábanas de máxima calidad, asegurando un pleno descanso y un sueño reparador.

Siete de las habitaciones se encuentran en la casa principal, y las cinco restantes se hallan en el antiguo pajar de 1887, que fue rehabilitado en el año 2005, manteniendo su estructura y carácter, generando así un gran contraste con los materiales de diseño que se han utilizado en el interior (azulejos de cristal color rojo para los baños, carpintería de cedro diseñada expresamente y suelo de piedra arenisca blanca).