Sant Joan de Binissaida aposta decididament per l’ecologia i el respecte al medi ambient. Entre les diferents iniciatives, destaquen les següents: 

• L’hotel disposa d’una planta d’energia fotovoltaica que produeix energia elèctrica.
• La producció d’aigua calenta de les cinc habitacions del boer s’aconsegueix gràcies a una instal·lació de plaques d’energia solar.
• L’hotel disposa de containers de reciclatge de paper, plàstic i vidre, respectivament, potenciant així la reutilització dels recursos i la disminució dels residus.
• Els llums que assenyalen els camins exteriors s’alimenten d’energia solar.
• Els nous WC estan equipats amb un sistema de control i estalvi d’aigua.
• S’han reforestat sis hectàrees (les més properes al mar) amb pins i ullastres, seguint les directrius del programa de reforestació de la Unió Europea.
• S’han recuperat totes les parets de pedra seca, tot seguint els mètodes de construcció originals, els quals no utilitzen ciment ni cap sistema de fixació.
• L’any 2000 es va rehabilitar l’antiga sínia rústica per a l’extracció animal de l’aigua amb un safareig, després d’estudiar els elements etnològics dels que havia estat construïda inicialment. Avui conté aigua i funciona com a l’antiguetat. Igualment, es va refer l’antic forn de pa, que avui en dia es pot utilitzar.
• Totes les zones del jardí, agrícoles i de bosc, estan magníficament conservades, oferint una bellesa natural incomparable.